本放送時放送形態
NHKアニメ
第１話 エッフェル塔の少女
放送日時 ： 2007年9月3日（月） 8：00 〜 8：30頃
第２話 小さな逃亡者
放送日時 ： 2007年9月4日（火） 8：00 〜 8：30頃
第３話 謎の大海獣
放送日時 ： 2007年9月5日（水） 8：00 〜 8：30頃
第４話 万能潜水艦ノーチラス号
放送日時 ： 2007年9月6日（木） 8：00 〜 8：30頃
第５話 マリーの島
放送日時 ： 2007年9月7日（金） 8：00 〜 8：30頃
第６話 孤島の要塞
放送日時 ： 2007年9月10日（月） 8：00 〜 8：30頃
第７話 バベルの塔
放送日時 ： 2007年9月11日（火） 8：00 〜 8：30頃
第８話 ナディア救出作戦
放送日時 ： 2007年9月12日（水） 8：00 〜 8：30頃
第９話 ネモの秘密
放送日時 ： 2007年9月13日（木） 8：00 〜 8：30頃
第10話 グラタンの活躍
放送日時 ： 2007年9月14日（金） 8：00 〜 8：30頃
第11話 ノーチラス号の新入生
第12話 グランディスの初恋
放送日時 ： 2007年9月17日（月） 8：00 〜 9：00頃
第13話 走れ! マリー
放送日時 ： 2007年9月18日（火） 8：00 〜 8：30頃
第14話 ディニクチスの谷
放送日時 ： 2007年9月19日（水） 8：00 〜 8：30頃
第15話 ノーチラス最大の危機
放送日時 ： 2007年9月20日（木） 8：00 〜 8：30頃
第16話 消えた大陸の秘密
放送日時 ： 2007年9月21日（金） 8：00 〜 8：30頃
第17話 ジャンの新発明
放送日時 ： 2007年9月24日（月） 8：00 〜 8：30頃
第18話 ノーチラス対ノーチラス号
放送日時 ： 2007年9月25日（火） 8：00 〜 8：30頃
第19話 ネモの親友
放送日時 ： 2007年9月26日（水） 8：00 〜 8：30頃
第20話 ジャンの失敗
放送日時 ： 2007年9月27日（木） 8：00 〜 8：30頃
第21話 さよなら・・・ノーチラス号
放送日時 ： 2007年9月28日（金） 8：00 〜 8：30頃
第22話 裏切りのエレクトラ
放送日時 ： 2007年10月1日（月） 8：00 〜 8：30頃
第23話 小さな漂流者
放送日時 ： 2007年10月2日（火） 8：00 〜 8：30頃
第24話 リンカーン島
放送日時 ： 2007年10月3日（水） 8：00 〜 8：30頃
第25話 はじめてのキス
放送日時 ： 2007年10月4日（木） 8：00 〜 8：30頃
第26話 ひとりぼっちのキング
放送日時 ： 2007年10月5日（金） 8：00 〜 8：30頃
第27話 魔女のいる島
第28話 流され島
放送日時 ： 2007年10月8日（月） 8：00 〜 9：00頃
第29話 キング対キング
放送日時 ： 2007年10月9日（火） 8：00 〜 8：30頃
第30話 地底の迷路
放送日時 ： 2007年10月10日（水） 8：00 〜 8：30頃
第31話 さらば、レッドノア
放送日時 ： 2007年10月11日（木） 8：00 〜 8：30頃
第32話 ナディアの初恋・・・？
放送日時 ： 2007年10月12日（金） 8：00 〜 8：30頃
第33話 キング救助作戦
放送日時 ： 2007年10月15日（月） 8：00 〜 8：30頃
第34話 いとしのナディア
放送日時 ： 2007年10月16日（火） 8：00 〜 8：30頃
第35話 ブルー・ウォーターの秘密
放送日時 ： 2007年10月17日（水） 8：00 〜 8：30頃
第36話 万能戦艦Ν-ノーチラス号
放送日時 ： 2007年10月18日（木） 8：00 〜 8：30頃
第37話 ネオ皇帝
放送日時 ： 2007年10月19日（金） 8：00 〜 8：30頃
第38話 宇宙日（そら）へ・・・
放送日時 ： 2007年10月22日（月） 8：00 〜 8：30頃
第39話 星を継ぐ者・・・
放送日時 ： 2007年10月23日（火） 8：00 〜 8：30頃
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ふしぎの海のナディア
DVD-BOX I
第１話 〜 第20話 収録
ふしぎの海のナディア
DVD-BOX II
第21話 〜 第39話 収録
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